龙眼ERF家族成员鉴定及其在体胚发生早期的表达

陈燕; 吕科良; 厉雪; 高玉莹; 林玉玲; 赖钟雄 福建农林大学园艺植物生物工程研究所; 福州350002

摘要:为了解龙眼ERF家族的基本性质以及在体胚发生早期的表达规律,该研究对龙眼基因组鉴定出108个ERF家族成员进行基本理化性质分析与进化树构建,并结合龙眼转录组及miRNA、lncRNA数据库对DlERF家族成员与lncRNA、miRNA之间的关系预测与表达模式分析。结果显示:(1)理化性质及进化树分析表明,AP2/ERF结构域在龙眼中相对最为保守,DlERF对龙眼的抗胁迫能力以及对病菌的防御能力可能起着重要作用。(2)RNA-Seq中的表达量分析可知,95个ERF基因在转录组中检测到表达,在愈伤组织(EC)、不完全胚性紧实结构(ICpEC)与球形胚(GE)阶段中分别存在31、11与53个ERF基因高表达。(3)qRT-PCR结果显示,在龙眼体胚发生早期显著表达5个ERF基因中,Dlo_008317.1ERF15-2、Dlo_022310.1ERF1-1与Dlo_009939.1ERF98在GE阶段表达量显著高于EC与ICpEC阶段,Dlo_009070.1ERF106-3与Dlo_022634.1ERF22-1则分别在EC与ICpEC阶段高表达。(4)DlERF家族成员与相关lncRNA、miRNA表达量分析显示,LTCONS_00013739对靶基因Dlo_008317.1ERF15-2为正调控关系;Dlo_miR413与Dlo_miR1510a共同靶向Dlo_009070.1ERF106-3,从EC到GE阶段均表现出显著负调控关系,而Dlo_miR413与Dlo_008317.1ERF15-2的表达量表现出正相关,推测相比于Dlo_008317.1ERF15-2,Dlo_miR413更倾向于调控Dlo_009070.1ERF106-3;调控Dlo_009939.1ERF98相关的Dlo_miR408与Dlo_miR774b,从表达趋势来看,Dlo_miR774b在龙眼体胚发生早期过程能够负调控Dlo_009939.1ERF98;Dlo_miR399c与Dlo_022310.1ERF1-1在EC到GE阶段可能存在负调控关系。(5)不同梯度浓度的乙烯处理使得DlERF基因表达显著下调。这些发现提供了有关龙眼体胚发生早期DlERF的重要见解,从而为将来对龙眼体胚发生早期过程中DlERF的功能分析奠定了基础。

来源期刊:西北植物学报
关键词:龙眼  体胚发生早期  erf  
来源期刊:西北植物学报 2018年第11期

期刊名称:西北植物学报

期刊级别:北大期刊

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